欲知巫山神女的传说，需要先了解巫山在今何地。
巫山，即今天所指巫峽。与瞿塘峡、西陵峽总称为长江三峽。在四川奉节县和湖北宜昌市之间。地处长江上游，山高滩多水急。
瞿塘峡，在四川奉节县东。
西陵峡，在湖北宜昌市西。
巫峽，在瞿塘峡和西陵峡之间，是三峡最高峻的山峰，故又名大巫山。
我国古代有一部记载全国水道的地理著作，名为《水经注》，其中记载有大小河流一百三十七条，用水记山、因地记事的方法，祥细地描述了书中所载河流的源流支派及流经之地的地形、气候、土壤、物产等。并介绍了沿途城邑的建制沿革，有关的历史事迹和神话传说等。其中的《江水》中的《巫山:巫峽》，记述了巫峽的地理位置及神话传说故事，用生动的语言描绘了大巫山挺拔巍峨的气势和三峽两岸的美丽如画的四季景色。展现出祖国河山的雄伟秀丽，是长江万里锦绣图中一幅出色的画卷。
其中，"丹山西即巫山者也。又帝女居焉。宋玉所谓:`天帝之季女，名曰瑶姬，未行而亡，封于:巫山之阳。精魂为草，寔为灵芝'。
是谓，'巫山之女，高唐之阻，旦为行云，暮为行雨，朝朝暮暮，阳台之下。‘
旦早视之，果如其言。故为立庙，号朝云焉。"
其中的"帝"，即天帝，也就是玉皇大帝。巫山神女，即玉皇大帝的女儿，实实在在的仙女。
怎见得？有后战国时楚国文学家宋玉作有《高唐赋》，称天帝最小的女儿，也就是传说中的仙女，尚未出嫁即亡故，埋葬在巫山南边，灵魂化为了仙草一一灵芝。
宋玉在《高唐赋》中自作主张，将神女写作与楚怀王遇合。楚怀王不舍问神女行止，神女答曰:吾早上变为朝云，晚上变成了雨雾。大概就是在巫山，具体的位置却不一定。
楚怀王给其立庙，号:朝云。
今人常将男女之情名为云雨，自是由此而来，但却显过于露骨。后世有文人作诗，曰:
两情若是长久时，
又岂在朝朝暮暮？！
关于巫山女神有真实的故事吗？既然是神就是造出来的东西，哪还有真实的故事，这个问话非常有意思。自身逻辑都不能自洽。