先问是不是，再问为什么。
日本TV动画并不只在晚上播出，比如我们都熟知的海贼王，在各个电视台的播出时间如下（现在可能有细微变动），可以看出基本是学生放学后的时间，甚至还有早上播放的。
大人气的例子说完了，再看看子供向的例子。哆啦A梦和蜡笔小新的播放时间也不在深夜，像这种联合特别节目还会放在7点这种不错的时段来播出。
实际上，对于日本动画产业来说，中流砥柱是哆啦A梦这种子供向，是海贼王这种大人气作品，我们所说的新番一般仅指日本深夜动画。这些动画本身就是市场细分和亚文化玩到极致的产物。2017年深夜档动画BD销量第一名是《冰上的尤里》，销量6万7千多张，这个销量所能带来的收入，和主流的日剧以及子供向动画的收入根本无法比较。
所以，深夜档动画之所以在深夜档，实则是被主流节目挤过去的。
因为在网络时代，当我们可以自由地在视频网站上观赏动画时，统计数据说明宅虽然比其他群体更能熬夜一点，但观看时段的波峰和波谷与一般人群并没有什么区别，都是晚上的7-11点。真正能熬到12点去追新番首播的人还是少数，一个例子就是，1月B站最热门的作品之一，《紫罗兰永恒花园》是在深夜更新的，不过从开播深夜到第二天中午的播放量一般只占前两天播放量的1/4—1/5，说明绝大多数的用户，并不会选择在深夜看动画。
好在时代在变，随着网络视频平台的盛行和4G流量越来越便宜，日本深夜动画也得到了新的发展契机，欧美那边有网飞花钱购买，中国这边过去一年的主力是B站和爱奇艺，原本是面对一小撮特定观众的深夜动画，如今也逐渐获得了展现在更多观众面前的机会，新形势下，深夜动画要如何求变，是获得腾飞还是因为内容太过狭隘重归小众，还需我们拭目以待。
其实理由很简单，是因为广告商和动画分类化。
当初动画大多也是在黄金档播出的，因为动画制作成本相对较低（就算低也差不多有1000万日元/集），而且大多是老少皆宜的动画，所以收视率也不错。但是到了后来，大家晚上的娱乐活动已经不仅限于电视节目了，加上网络的发展，收视率大跌，导致电视台的广告主们很不高兴，所以大量没什么收视率的动画被移除了黄金档，把黄金档的时间让给一些收视率高的电视剧，综艺等，能留在黄金档的都是一些买周边赚钱的全年龄动画，比如《面包超人》。
另外，因为日本独有 的制作委员会模式，动画都是向电视台买播放时间的，就是说，你要播放动画，你是需要给电视台钱的，而深夜时间钱要便宜很多，并不是所有的动画公司都那么有钱的，所以动画扎堆的选择深夜档时间播放，导致我们看到的动画差不多都是深夜番。
不过把这个概念定型的，是来自这三部动画：《EVA》《逮捕令》和《高达》。90年代后期，这三部神作动画在深夜档重播，取得了超高的收视率，这让动画制作方恍然大悟：原来看动画的御宅们都是一群昼伏夜出的夜猫子！！从此之后，日本动画几乎就抢在深夜档了。
当然，现在动画题材的敏感和内容少儿不宜也是一个原因啦。