每个人理解都不一样，这也是官方不说明白的目的，因为对人类自身的思考就没有一个统一答案，为什么想掐死明日香，恶心又是什么意思，每个人套用自己的世界观去理解都会不一样，这也是Eva能够成为神作的一个原因，它不定义一个唯一的世界观，只是在这样一个世界里，把人物之间的故事和矛盾展露出来，由观众去讨论，所以才有这么多解读。
就简单的理解来说，男主本身代表了人类自身，有着所有的弱点，也有着最本质的善良。绫波丽则代表了全知的世界法则，她本身就是这个世界的命运，但她自己不会下决定，她知晓一切，在遇到男主前，她只是作为一个旁观者，看着司令的作为不去干预，服从司令的意志。明日香则是一个故事的推动点，很多故事的关键走向受到了明日香的影响，她与绫波丽，与男主，与自身的情感，把几个人物的矛盾串了起来。男主从绫波丽身上感受到了想要做主角的冲动，为什么?因为绫波丽就是这个世界的法则，男主如果能拥有绫波丽就能改变世界，但男主退缩了，因为他憧憬的父亲挡在她面前，他的懦弱阻止了他进一步了解事实。男主从明日香身上看到的就是自己的欲望，他不敢染指绫波丽，于是转向了明日香，这便是他作为一个人类，展示出来的另一个弱点。
为什么他想掐死明日香，因为他明明决定不再背负一切，想要毁灭一切，但绫波丽作为法则，执行男主意愿的时候，却留下了明日香，这说明男主自己所期待的只是逃避，把他不想背负的负担甩给了绫波丽，而忠于了自己的欲望，他发觉了自己在与最后使徒的对话后，还是这样懦弱，明明被寄托了期待，还是没办法完成该做的事情，最后一事无成，这样的自己不可原谅，于是在这一刻对自己的厌恶让他想掐死明日香否定这个结果，但他最后又接受了这个结果，他害怕了，没有勇气面对自己一个人的结局，他还是选择了妥协，服从自身的懦弱。明日香在这一刻从混沌里回到现实，她看到了男主的选择，包括自己，这一整件事，让她感觉，也许人类就是这样，懦弱又忠于自身，想要改变又无力承担，做着堂皇的事情，却是一个失败的结局，矛盾的，复杂的，令自己恶心的。
其实大家都想多了，依照痞子的特性，估计是编不下去了，毁灭、清零或者遁入黑暗绝对是痞子的特点，其实EVA的结局和《不可思议的兰迪亚》的结局有多相似啊。