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萨沙第9218条回答。
其实很简单，在神雕侠侣的最后，重阳宫被蒙古军队放火烧毁。
个人认为，全真教随后就解体了，或者是换了另外一个形式存在。
大家注意，六大门派中，武当派还不存在，昆仑派、峨眉派、崆峒派也不存在，只剩下一个少林派。
而根据时间推算，少林寺真是火工头陀闹事后的衰败期。因为火工头陀事件，当时少林寺三个支柱的达摩堂首座苦智被打死，罗汉堂首座苦慧气的远走西域，只剩下方丈唱独角戏。
可见，少林派陷入内乱，不能对蒙古人构成威胁。
相反，全真教本来就是反金的英雄王重阳建立，后来也是武林反抗蒙古人的大本营之一。
大家注意，郭靖黄蓉领导的襄阳军人和丐帮江湖好汉对抗蒙古人中，全真教始终都是在热情帮助。
在武林大会上，全真教郝大通明知道可能被金轮法王打死，也是要上去，不怕牺牲。
后来蒙古人试图操纵赵志敬和尹志平掌控全真教，又失败了，只能派人将全真教的道观烧毁。
很可能，全真教由此就垮了，理由如下：
第一，同蒙古人作对并没有好处。
为什么蒙古人不诛灭丐帮，因为丐帮是四处流动的帮派，蒙古人根本就消灭不了。
而且用《武状元苏乞儿》周星驰的话来说，只要朝廷施政不力，就会有大量乞丐、流民存在，才会有丐帮存在。
但是，全真教就不同了，全真教是有固定场所的，根本挡不住蒙古人的持续攻击。
事实证明，全真教的几百个道士，武功大多还可以，在武林中是举足轻重的势力。
但是，蒙古人只要派几千兵马，剿灭全真教就没有问题。
因为打仗和单挑不是一回事，全真教的道士武功高强，遇到蒙古人几阵箭雨下去（数千支箭一起射过去），也就一二流高手可以活命，其他道士都得送命。
而全真教一二流高手最多几十人而已，没什么了不起，遇到蒙古大军也是完蛋。
退一步说，蒙古人就算不派遣军队，派遣武功高手来也足够了。
大家也知道，全真七子的谭处端被欧阳锋打死，神雕后期又少了一个，应该是马钰或者刘处玄因年老而病死。
而全真七子的武功尚且不如金轮法王的徒弟和达尔巴，当然也不如潇湘子、尹克西，更别说金轮法王了。
可以说，只要金轮法王带着另外4个人去踢馆，可以全歼全真七子和赵志敬、尹志平等比较厉害的二代弟子。
剩下那些小道士，人数虽多，随便找些武林三流好手就能对付了。
所以，蒙古人消灭全真教是没有问题的。
第二，全真教的武功有问题。
虽然是玄门正宗，都需要漫长的时间练习武功，但全真教有很大问题，大大不如少林寺。
少林寺的武功也是佛门正宗，动辄要学习个三五十年。
但是少林派武功还是很实用的，都大锦是少林俗家弟子，大概30岁时候离开少林寺。
都大锦的武功在少林寺顶多是二流水平：就凭总镖头这二十四手降魔掌和四十九枚连珠钢镖。
但是，就都大锦的武功，行走江湖对付一般敌人，是足够了。
所以，都大锦的龙门镖局才很红火： 都大锦强抑怒气，说道“我这龙门镖局开设二十年来，官镖、盐镖，金银珠宝，再大的生意也接过，可从来没出过半点岔子。”
而少林寺的特点是，虽然学三五十年，火候到了一定会有一流甚至超一流高手。
倚天屠龙记中，少林派除了四大神僧以外，还有少林三渡，这七个人都是超一流高手。
张无忌认为，少林寺一流和超一流级别高手有六七十人之多，这是其他任何门派无法达到的，只有帮会、教派才能达到。
另外，即便少林派的二流高手，比如都大锦这种在江湖上已经相当牛逼了。
少林寺三个二流好手，几乎同张翠山打成平手。而这三个二流好手在少林寺也就是小角色，平时都没有说话的份，都是听人吩咐。
但是，全真教武功就很要命。
全真七子武功就是最高的，第二代弟子都大大不如全真七子。
但是，七子的武功也就是一流而已，远不到超一流，连霍都和达尔巴都打不过。
而尹志平之流充其量就是二流水平，行走江湖是勉强够了，遇到强敌就完。
高手不行，普通道士呢？
在少林寺练武10多年，都大锦就可以行走江湖，开设龙门镖局，20多年少有敌手。
但是，全真教武功不行，学习武功10多年的普通道士，很多武功连三流也达不到，是四五流水平，行走江湖是送死。
第三，全真教内部问题太多。
全真七子还凑合，下一代尹志平是个淫贼，赵志敬人品低劣，其余弟子很多不三不四。
其实，全真七子也有一些问题。
比如丘处机，明明知道杨康是金国小王爷，他爸爸又不不是好东西，怎么能教这种人学武呢？丘处机就是为了自己争强好胜，不愿意认输。
再看孙不二，这个女人心胸较为狭窄，对杨过和小龙女一直比较嫉恨。
还有马钰，虽人品很高，但作为掌权却有很多失察的地方。杨过被赵志敬欺负的事情，马钰茫然无知。
而且明显这些道士更像普通人，七情六欲都很多，并不是像少林僧人一样平时不出寺庙，就在庙内隐居修行。
所以，最后赵志敬在蒙古人帮助下篡位，差点就搞垮了全真教。
第四，全真教可能换了个壳，继续发展。
全真教的武功毕竟是玄门正宗，威力也是很强的，不是不三不四的武功。
全真教虽然面对蒙古人的威胁，可能分散各地发展，一部分道士甚至可能投靠元朝，但不可能彻底消亡。
全真教消失是宋末元初的事情，元末的倚天屠龙记中没有全真教存在，也没有类似的教派。
可见，全真教投靠元朝的那部分，被武林人士当作汉奸，已经无法在中原武林立足。
而没有投靠元朝的，实力较为弱小，在武林中没什么分量。
不过，明代就出现了疑似全真教传人。
首先是明朝中期的笑傲江湖，有人说华山派其实就是全真教。
虽然倚天屠龙记也有华山派，但里面高手没有一个是用剑的，鲜于通用扇子，华山二老用刀。而笑傲江湖的华山派则只是用剑，并没有其他任何一种武器。
而华山二老和鲜于通的武功，同华山派剑宗和气宗都有极大差别。
相反，全真教就是用剑的，以剑招极强闻名于世。另外，全真教也是以内功著称，是玄门正宗。
有人说，其实倚天屠龙记中的华山派，在鲜于通死后因为互相内讧，在明代初期就消亡了。
而全真教本来是在陕西终南山，距离陕西华山也不远，可能是分支逃过去的。
他们应该最初只是个小道观，在华山派覆灭以后才逐步强大起来。由于蒙古人的追杀，他们已经低调发展。随着蒙古人垮台，明代建立，他们才壮大起来，但始终不抛头露面。
直到华山二祖偷看了葵花宝典以后，产生了巨大的分歧，才亮出了华山派的门户，还很快分为剑宗和气宗。
大家注意，华山二组在量门户之前，武功就不错了，也颇为有名气，不然也不可能受到南少林的热烈接待。
所以，华山派可能就是全真教分支转变而来。
不过，这个华山派在笑傲江湖时代就完了，岳不群死后门派就覆灭。
后来的华山派，其实是风清扬创建的，同之前华山派有很大区别，只是名字相同罢了。
那么，全真教武功由此失传？
也不是。
在明朝后期的侠客行里面，有个上清观，石清闵柔都是上清观的弟子，武功是武林顶尖的。
而上清观的高手众多，掌门人比石清还要厉害。
上清观除了是道家一派，还擅长剑法和内功，看来很有可能是全真教另一个分支。
只是上清观高手虽多，门派仍然不大，只是一个中等规模道观而已，在江湖上很低调。
可见，明代就有两个门派是全真教分支，到了清代应该还有。
不过，由于相隔时间太久，这些分支教派应该逐步本土化，同最初全真教已经完全不同了。
全真教在《射雕英雄传》前期王重阳在世的时候处于巅峰状态，王重阳一死，全真七子武功平庸，全真教就开始走下坡路。到了《神雕侠侣》时代，全真教第三代弟子无论人品武功都极差。当时教中较为突出的弟子是王处一门下的赵志敬和丘处机门下的尹志平。
赵志敬是玉阳子王处一的大徒弟，在全真教第三代“志”字辈弟子中，他的武功最高。可是他因不满掌教之位落于师弟尹志平身上，不惜和蒙古人勾结，以夺取全真派掌门之位。后来以尹志平当年奸污小龙女为把柄，要挟尹志平交出掌教之位。最后被周伯通放玉峰蛰死。
尹志平就不用多说了，因曾经沾污小龙女而自刎于小龙女剑下。至于全真教第三代中其他弟子，则更加平庸，不值一提了。因此待到全真七子和周伯通一死，全真教便要彻底没落。加上蒙古大军的大举入侵和元朝的建立，全真教即使不解散，也难免湮灭于战乱之中。
《倚天屠龙记》的时代背景是元末，虽然元朝只有短短的九十八年，但数十年时间足以让世人遗忘一个教派了。在《倚天屠龙记》中，别说全真教，就连《射雕英雄传》中的“五绝”也未曾被提起过。只能说，长江后浪推前浪，一代新人换旧人！