西京、唐都、口腔、原451、原323从前年军改后已陆陆续续都划归空军军医大学，四医大已经是过去式了。随便拉出来一个都是佼佼者，更别说强强强强强结合体了，想想都头大，跟谁比，咋比，没法比。
以西京为代表的西部龙头医疗机构，不仅设备齐全先进，全军（国内）数一数二的专家一抓一大把，拥有庞大的科研队伍，军事化管理，医德医风有着先天优势，这点是地方医院永远无法超越的鸿沟。作风建设过硬，既承担了很多国家重点项目，同时也拥有自己的人才培养基地（空军军医大学，原四医大），综合实力在国内也是名列前矛的。大家吐槽西京唐都服务的同时可能忽视了一点，“军人优先”这四个字，近两年军改后，军人优先被提高到了前所未有的高度。大家说排不上号不仅是因为医术权威使很多周边省市（甘青宁晋豫）的患者慕名而来，看起来全年基本都在排队也就不足为奇了。还有一个很重要的因素就是因为军人随时可以插队。西安以及周边的部队驻军也有十几万。所以，不能用地方医院的标准去评价部队医疗机构的服务，服务地方不是首要任务。这种地方先讲政治，当然服务也要讲，但相比之下就没有那么突出了。费用就是再贵，对于现役军人来说，各种减免，各种绿色通道，各种报销下来也花不了几个钱。所以，大家认为的贵只是针对地方患者而言。这么说吧，西京在西北乃至整个中国的中西部地区的地位相当于北京的协和。
交大一二附属医院也是人才济济，西北地区甚至国内专家云集，尤其是在军改时从军大的西京、唐都等附属医院（现空军军医大学，原四医大）挖来了很多人才专家，所以综合实力直线上升，医疗设备也很齐全，在本地口碑很好，费用相比没有西京那么硬。作为地方医院，医疗技术和服务也都具备了一定的区域优势。凡是能叫出名字的病，几乎都能治。疗效也不比西京差多少。但是在内部管理和作风建设上跟西京有差距，这是由体制决定的。就医流程和用药方面也不如部队医院那么严谨。但也属于西北地区三甲医院里的佼佼者。
这两类虽说都是医院，但一个是军队机构（归空军直属管理），另一类是地方单位，两者虽属同一个行业但机制不同，所以在很多地方没法去平行比较，没有可比性。题主非要问谁厉害，这话问的本身就点小别扭了。
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最新补充：2020新冠肺炎期间，空医大从校本部、西京、唐都等多个附属医院紧急抽调143名勇士做为全国首批驰援武汉的队伍，在除夕之夜登上空军伊尔-76运输机，两小时后安全降落在湖北武汉天河国际机场。
作为一个医生，来回答这个问题。
这三个医院的侧重点不太一样。西京医院和唐都医院普遍的外科都比较厉害。内科，稍微差一点，但是也很厉害。交大二附院，外科就没有内科声望高，普遍的外科没那么强。三家医院都可以，具体到科室，这取决于想看什么病。医院哪个强？哪个弱？其实没有什么参考价值。你看看具体的专科排名。西京医院的外科那是一骑绝尘。因为国内很多外科专科的创始人，曾在这个医院工作。