谢谢邀请，其实这个问题真的造成了很多观众的困惑，细心看过电影的朋友都知道教授确实是被黑化的琴给秒了，当时在场的万磁王都惊呆了一脸懵逼的样子，因为我们都知道查尔斯教授和万磁王是好基友，而且老万是真的没想到琴的力量会强大到那样的程度，所以在影片的正片中我们都坚信查尔斯确实已经被杀死了。
但是说回到认真看电影这个话题就有趣了，电影中有这样一个情节，查尔斯教授讲过一个关于伦理道德的问题，可不可以把一个患了癌症的四个孩子的父亲的意识移植到一个天生没有高级脑功能的但是身体器官和神经功能都正常的人的身体上，如何界定这种行为，这是否符合伦理道德。其实这个问题就是电影里面为后面的彩蛋挖的坑，对漫威漫改电影的特色彩蛋，影片结尾处一个卧床的病人突然开口说话了，而护士惊喜的叫到查尔斯，其实床上这个人大有来头，他和查尔斯是孪生兄弟，在母体时就因为查尔斯的脑电波过于强大被弄成了植物人，而在查尔斯被琴秒杀之时，教授用自己强大的能力将意识转移到了孪生兄弟的身体中，所以说呢查尔斯的肉体确实被琴杀死了，但是精神意识体却逃离了。附身在弟弟身上的查尔斯真正意义上并没有死。
至于在狼三中被杀上面说了查尔斯本质上没死啊，所以才可以被又一次杀死。
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并非真正意义上的死亡，在影片最后他的好朋友莫拉博士在面对呼唤自己的病人时非常惊讶的叫出:查尔斯。这算是个彩蛋吧
当时查尔斯为了唤醒已经失去自我意识的琴格雷而被黑凤凰强大的力量击中，查尔斯并未完全死掉，他用超能力将自己的意识转入了一个天生没有意识的人的大脑内，实现了某种意义上的重生。